Vigilância proativa para garantir uma deteção ampla das estirpes de gripe

Vírus: Mudança e desvio

Os vírus mudam constantemente por mutação. Dois mecanismos principais causam estas alterações. O desvio genético é uma alteração gradual na composição genética de um vírus devido a uma série de mutações genéticas menores.¹ Nos vírus da gripe, o desvio genético resulta em pequenas alterações nas proteínas da superfície viral. A mudança genética, por outro lado, é uma alteração abrupta e significativa na composição genética de um vírus que muitas vezes cria uma nova estirpe. A mudança genética cria proteínas de superfície substancialmente diferentes e pode dar aos vírus da gripe de origem animal a capacidade de infetar humanos, potencialmente causando surtos em populações humanas.¹

As alterações nas sequências genéticas virais podem ter impacto no desempenho dos testes de diagnóstico molecular. Se um teste for concebido para detetar uma sequência viral específica e essa sequência mudar devido a mutação, o teste pode não detetar o vírus. A gripe, ou vírus da gripe, é propensa a essas mutações.

Para evitar impactos nos seus testes de gripe baseados em PCR, a Cepheid concebe cada teste para detetar vários genes da gripe. Isto reduz o impacto de uma mutação numa determinada sequência genética, uma vez que existem outras sequências únicas para permitir a deteção (ou seja, redundância do alvo). Para a gripe A, estão incluídos três genes-alvo para detetar estirpes adaptadas ao ser humano e muitas estirpes aviárias. Além disso, estão incluídos dois genes-alvo para a gripe B.

Vigilância proativa do desempenho do teste

A Cepheid monitoriza atentamente os dados de vigilância de estirpes para se manter atualizada sobre a natureza em evolução dos vírus da gripe. A Cepheid utiliza análises in silico, bem como testes in vitro para monitorizar a cobertura da estirpe de gripe dos seus testes de diagnóstico. A análise in silico (ou seja, experiências realizadas por computador) consulta as bases de dados de sequências disponíveis para prever a capacidade de um teste de detetar estirpes de gripe relevantes avaliando quão bem as sequências de teste de PCR correspondem às sequências-alvo virais. A análise in silico da Cepheid utiliza todas as sequências do vírus influenza disponíveis na base de dados da iniciativa global de partilha de todos os dados sobre o vírus influenza (GISAID) (https://gisaid.org/). Como em dezembro2023, estavam disponíveis e foram incluídas na análise mais 18 000 sequências da gripe A humana e mais 7000 sequências da gripe B humana.

Também são realizados testes in vitro (experimentações realizadas em tubo de ensaio ou placa de laboratório) de isolados de vírus influenza, utilizando o painel anual de Reatividade Analítica da Influenza do Centro de Avaliação e Investigação Biológica da Food and Drug Administration (CBER da FDA). O painel CBER da FDA contém vírus humanos atuais, incluindo estirpes recomendadas pela Organização Mundial de Saúde para a vacina anual contra a gripe.

Para garantir a cobertura e o desempenho contínuos da estirpe de gripe, a Cepheid realiza análises in silico e in vitro para os seus testes Xpert®Xpress Flu/RSV e Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus (coletivamente referidos aqui como Xpert Xpress). Estes testes de diagnóstico in vitro multiplex contêm ambos vários alvos de gripe.

Deteção de estirpes da gripe A aviária

Com preocupações crescentes sobre a gripe aviária, “gripe das aves”, incluindo casos humanos recentes,² a cobertura da estirpe aviária, incluindo a estirpe H5N1, é crucial para testes de diagnóstico. Até agosto de 2023, estavam disponíveis mais de 5000 sequências de subtipos de gripe A aviária no GISAID e incluídas na análise in silico da Cepheid. Foram incluídas estirpes aviárias recentes preocupantes, 2024 H5N1 clade Guangdong 2.3.4.4b, H5N1/A/Cambodia/NPH230032/2023 e H3N8/A/Guangdong/ZS-2023SF005/2023.

Results from the combination of in silico analysis and in vitro testing demonstrate that the Xpert Xpress influenza tests will detect a wide range of current human and avian influenza virus strains, and is predicted to detect the highly pathogenic 2024 H5N1 Guangdong clade 2.3.4.4b that has been reported in outbreaks in dairy cattle and humans in the U.S.^2-4

Preparação para surtos

A capacidade de um teste de diagnóstico detetar com precisão diferentes estirpes de um vírus pode permitir a deteção e vigilância precoces de estirpes novas ou emergentes, diagnósticos confiantes para medidas de tratamento e isolamento e potencialmente informar estratégias de saúde pública para preparação para surtos.

A partilha contínua de dados, incluindo as contribuições valiosas da comunidade científica que gerou e partilhou dados de sequenciação da gripe através da Iniciativa GISAID, combinada com a vigilância proativa contínua, irá posicionar iniciativas de saúde pública e global para detetar estirpes emergentes precocemente e evitar surtos futuros.

Contacte-nos para solicitar o Boletim de Assuntos Médicos/Científicos da Cepheid: Influenza Inclusivity of Cepheid Tests — 2023 para um relatório completo dos métodos e resultados desta análise.

Saiba mais sobre os testes de gripe da Cepheid aqui.