OncoMark

{{searchText ? ' for "' : ''}}{{searchText}}{{searchText ? '"' : ''}}

Xpert® Insight Breast Cancer[1] on Cepheidillä kehitteillä oleva uusi testi. Tämä multiplex mRNA-ekspressiotesti on suunniteltu mittaamaan kuuden geenin (3 biomarkkeria ja 3 kontrollia) ekspressiotasoa formaliinifiksoidusta, parafiiniin valetusta rintasyöpäkudoksesta potilailta, joilla on varhaisen vaiheen invasiivinen rintasyöpä. Näiden geenien painotettu ekspressio yhdistetään kahteen kliiniseen vaikutustekijään (kasvaimen koko ja nodaalisuus) patentoidun algoritmin avulla. Näin saadaan binäärinen riskiarvo (korkea riski tai matala riski), joka on suunniteltu ennustamaan taudin uusiutumista seuraavien 10 vuoden kuluessa. 

Testin on alunperin kehittänyt Oncomark, irlantilainen biotekniikkayhtiö, ja se tunnettiin aluksi nimellä OncoMasTRTM. Cepheid ja OncoMark aloittivat yhteistyön vuonna 2018 tutkiakseen OncoMasTR-testin GeneXpert® -järjestelmässä käytettävän version kehittämistä. Menestyksekäs yhteistyö johti siihen, että Cepheid osti OncoMarkin ja OncoMasTR-teknologian maaliskuussa 2021. Cepheid aikoo tuoda sen markkinoille nimellä Xpert Insight Breast Cancer.

OncoMasTR:n kehitystyö alkoi vuonna 2014. Alta löydät kehitystyön tärkeitä virstanpylväitä kahdeksan viime vuoden ajalta.

[1] Kehitteillä oleva tuote. Ei käytettäväksi diagnostiikkatoimenpiteissä. Ei minkään sääntelyelimen tarkastama.

Vuosi

 

Tuotekehityksen virstanpylväs

 

2014

OncoMasTR-teknologiaan liittyvästä alkuperäisestä keksinnöstä ilmoittivat yhdessä University College of Dublin ja Trinity College Dublin, keksijät olivat Bracken, Lanigan ja Gallagher.

 

2015

Asiaan liittyvä vertaisarvioitu julkaisu: 

- Lanigan F et al. Delineating transcriptional networks of prognostic gene signatures refines treatment recommendations for lymph node-negative breast cancer patients. FEBS J 2015; 282:3455-73.

Avainasiota Lanigan et al.:n löydöstutkimuksesta:

  • ARACNe: Geenisäätelyverkostoja rakentava bioinformaattinen menetelmä.
  • ”Mitkä geenit säätelevät kolmea, rintasyöpäennusteelle tunnusominaisiin piirteisiin vaikuttavia jo tunnettuja prognostisia geenejä?” 
  • Määritettiin kymmenen ”transkription pääsäätelijän” (Master Transcriptional Regulator, MTR) joukko.
  • MTR-alijoukosta, jonka on osoitettu ennustavan rintasyövästä selviämistä (mRNA ja proteiinitaso), laadittiin perusriskipisteytys.

 

2016

OncoMasTR:n kehitystyö OncoMarkilla

Tuotekehitystyön tärkeimmät johtopäätökset:

  • Pitkäaikaisia tuloksia sisältävän kliinisen näytekohortin (”peräkkäinen kohortti”, n=225, 37 etäistä uusiutumista), avulla kehitettiin ja optimoitiin 3-geeninen tunnusominaisuus, johon kuuluvat FOXM1-, PTTG1- ja ZN367-geenit (jäljempänä FPZ).    
  • Tästä 3-geenisestä tunnusominaisuudesta johdettiin kolme FPZ-perusteista riskipisteytystä:

     i.    Molekyylitason numeerinen riskipisteytys (0-100)
             ii.    Molekyylitason ja kliininen numeerinen riskipisteytys (0-10)
            iii.    Molekyylitason ja kliininen kategorinen riskipisteytys (matala, jos riski <5, korkea, jos riski ≥5)

 

2017

Asiaan liittyvä vertaisarvioitu julkaisu: 

- Moran B et al. Master Transcriptional Regulators in Cancer: Discovery via Reverse Engineering Approaches 

and Subsequent Validation. Conceptual bioinformatic framework for finding master control genes. Cancer Res. 2017; 77(9):2186-90.

- OncoMasTR-testin koulutus ja varmennus saatiin valmiiksi ja tiedot esiteltiin San Antonion rintasyöpäsymposiumissa.

- Samanaikaisesti suoritettiin jatkokehitystä ja validoivia tutkimuksia CLSI:n ohjeistuksen mukaisesti (Analytical Validation of OncoMasTR according to CLSI Guidelines: Precision, Linearity, Sensitivity, RNA Input, Interference, Kit Stability).

 

2018

OncoMasTR-testi sai CE-IVD-direktiivin mukaisen CE-merkinnän.

Aloitettiin kolme riippumatonta ulkoista kliinistä validointitutkimusta, joissa OncoMasTR-testille käytettiin ennalta määritettyjä riskipisteytyksiä:

  1. TransATAC (n=646)
  2. TAILORx (n=404), laajemman TAILORx-kokeen irlantilainen alijoukko.
  3. ABCSG-8 (n=1 087)

Yhdessä näihin kolmeen tutkimukseen sisältyi FFPE-näytteitä yli 2000 naiselta, joilla oli ER-positiivinen, HER2-negatiivinen aikaisen vaiheen rintasyöpä (imusolmukenegatiivinen tai 1-3 imusolmuketta positiivisia).

Kliinisten validointitutkimusten tärkeimpiä johtopäätöksiä:

  • OncoMasTR oli merkitsevän prognostinen etäuusimisen (DR) osalta kaikissa kolmessa tutkimuksessa.
  • Kahdessa tutkimuksessa (TransATAC ja TAILORx:n (irlantilainen) alijoukko), joissa oli saatavilla vertailuanalyysejä tukevaa tietoa, OncoMasTR tarjosi ensiluokkaisen prognoosiarvon Oncotype DXTM -uusimisarvoon (Recurrence Score, RS) verrattuna.

Cepheid ja OncoMark aloittavat keskustelun yhteistyöstä kehittääkseen GeneXpert-version OncoMasTR-testistä.

 

2019

OncoMark aloitti OncoMasTR-testin hajautetut todellisen käytön arvioinnit kolmessa paikassa:

  1. St Jamesin sairaalassa, Irlannissa
  2. Beaumontin sairaalassa, Irlannissa
  3. Utrechtin lääketieteellisessä keskuksessa, Alankomaissa
  4. Lundin yliopistossa, Ruotsissa

Tärkeimmät johtopäätökset beta-testauksesta toimipaikoilla ja analyyttinen validointi (CLSI-ohjeistuksen mukainen OncoMasTR:n analyyttinen validointi):

  • OncoMasTR:n analyyttinen suorituskyky on vakaa ja on mahdollista, että se sopii hajautettuun käyttöön. 
  • OncoMasTR:n yleinen tarkkuus on korkea, sen keskipoikkeama on 0,16 (<2 % 10-yksikköisestä riskipistealueesta)
  • OncoMasTR-pisteytykset olivat johdonmukaisia koko >100-kertaisella RNA-syötealueella
    • 4 koetoimipaikalla OncoMasTR:n jatkuvan riskipisteytyksen korrelaatiokertoimet olivat 0,94 – 0,96 ja kategorisen pisteytyksen vastaavuus oli 86 – 96 %.

Cepheid ja OncoMark käynnistävät muodollisen yhteistyön kehittääkseen GeneXpert-version OncoMasTR-testistä. 

 

2020

Asiaan liittyvä vertaisarvioitu julkaisu: 

- Buus R et al. Validation of the OncoMasTR risk score in estrogen receptor-positive/HER2-negative patients:
A TransATAC study. Clin Can Res. 2020; 26:623-31.

- Mazo C et al. Multi-gene prognostic signatures and prediction of pathological sponse to neoadjuvant chemotherapy in ER-positive, HER2-negative breast cancer patients. Cancers 2020; 12(5):1133.

Cepheid antaa kauppanimen Xpert Insight Breast Cancer OncoMasTR-testin GeneXpert-versiolle.

Cepheid osoittaa, että Xpert Insight Breast Cancer vastaa analyyttisesti OncoMasTR-testiä.

Cepheid osoittaa kuvailtujen näytteiden riskipisteytysten raportoinnin luotettavuuden Xpert Insight Breast Cancerin ja OncoMasTR:n välillä.

 

2021

Asiaan liittyvä vertaisarvioitu julkaisu:

- Lynch SM et al. Prognostic value of the 6-gene OncoMasTR assay in hormone receptor-positive HER2-negative early-stage breast cancer: Comparative analysis with   standard clinicopathological factors. Eu J Can. 2021; 152: 78-79.

- Filipits F et al. The OncoMasTR assay predicts distant recurrence in estrogen     receptor-positive, HER2-negative early stage breast cancer: A validation study in ABCSG Trial 8. Clin Cancer Res. 2021 Nov 1;27(21):5931-5938. 

Cepheid ostaa OncoMarkin ja OncoMasTR-testin.

Cepheid osoittaa Xpert Insight Breast Cancerin ja OncoMasTR:n kliinisen vastaavuuden FFPE-näytteillä, joilla on pitkäaikaisia tuloksia.

Cepheid aloittaa todellisen käytön todiste- ja kliiniset validointitutkimukset Xpert Insight Breast Cancer -prototyyppitestiä varten.

 

2022

Asiaan liittyvä vertaisarvioitu julkaisu:

- Loughman T et al. Analytical Validation of the OncoMasTR Assay, a Novel Multigene Signature for Prediction 
of Distant Recurrence in Estrogen Receptor-Positive, HER2-Negative, Early-Stage Breast Cancer. Clin Chemistry. 2022; 68:6. https://doi.org/10.1093/clinchem/hvac028

Jos haluat lisätietoa tai osallistua Cepheidin kanssa Xpert Insight Breast Cancer RUO -testin yhteisarviointiin, ota yhteyttä Cepheidin lääketieteellisten ja tieteellisten asioiden ja strategian osaston onkologian tiimiin osoitteella: MedSci.Oncology@Cepheid.com

Powered by Translations.com GlobalLink Web SoftwarePowered by GlobalLink Web