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19 février 2026
SANTÉ RESPIRATOIRE
Article
Transformer le diagnostic d’infection respiratoire : adopter l’innovation moléculaire dans la pratique clinique
Par le Dr Raúl Ortiz de Lejarazu, Ph. D. Médecine, microbiologie médicale et bactériologie; directeur émérite du National Influenza Center à Valladolid et conseiller scientifique pour Cepheid en Espagne.
Un point tournant dans le diagnostic respiratoire
Les infections respiratoires demeurent l’une des causes les plus fréquentes de consultations médicales en Espagne. Pourtant, pendant trop longtemps, les cliniciens ont été contraints de prendre des décisions sans bénéficier de diagnostics rapides et précis. Ce paysage change grâce à l’innovation moléculaire.
« En médecine clinique et en microbiologie, nous exerçons souvent nos activités dans l’obscurité. Maintenant que nous pouvons avoir de la lumière, nous devons en profiter. »
En mai 2025, un consensus pluridisciplinaire de Delphi, appuyé par neuf spécialistes espagnols de différentes sociétés médicales, a été publié dans le Journal of Diagnostic Microbiology & Infectious Disease1. J’ai eu l’honneur de coordonner ce groupe. Ensemble, nous avons fourni des recommandations nationales mises à jour qui reconnaissent le rôle central des diagnostics moléculaires rapides dans la prise en charge des infections respiratoires aiguës (IRA).
Des cultures lentes aux résultats moléculaires rapides
Il y a deux décennies à peine, la culture cellulaire et les tests antigéniques pouvaient prendre jusqu’à 48 heures,2 beaucoup trop lents pour influer sur le traitement de manière significative. Les diagnostics moléculaires ont tout changé.
Aujourd’hui, les tests PCR rapides peuvent permettre d’identifier des agents pathogènes comme la grippe, le VRS et SARS-CoV-2. Pour la grippe, il permet un traitement dans les 12 premières heures suivant l’apparition des symptômes, ce qui atténue la maladie, accélère le retour aux activités normales et évite l’utilisation inutile d’antibiotiques3.
« Ce qui prenait autrefois des jours prend maintenant quelques minutes. Il ne s’agit pas seulement d’une percée scientifique, mais aussi d’un impératif clinique. »
Principales recommandations du consensus Delphi1
Notre consensus souligne l’importance des tests PCR rapides pour :
- Tous les patients hospitalisés atteints d’une IRA symptomatique
- Populations à risque élevé : personnes âgées, personnes immunodéprimées et patients présentant des comorbidités
- Patients pédiatriques ayant besoin de soins spécialisés
Les diagnostics rapides favorisent également :
- La gestion des antimicrobiens en réduisant l’utilisation inutile d’antibiotiques
- L’amélioration du flux de patients et la réduction de la transmission nosocomiale dans les hôpitaux et les centres de soins de longue durée
- L’amélioration du rapport coût-efficacité dans les hôpitaux (par rapport aux tests antigéniques)
Soins de première ligne : La prochaine frontière
Un défi clé demeure : étendre les tests moléculaires aux soins primaires et aux services d’urgence, là où la plupart des cas respiratoires commencent4. Cela nécessite des investissements et des données probantes, non seulement en matière de rentabilité, mais également en matière d’impact social et organisationnel.
« Notre prochaine étape consiste à éclairer les premiers points de contact avec les patients avec la même clarté que celle que nous avons apportée aux hôpitaux. »
Le groupe de travail demande la mise en œuvre à plus grande échelle de tests moléculaires au plus proche des patients et d’autres études pour valider leur impact dans les milieux communautaires.
Un appel à l’action
Les outils existent maintenant pour transformer notre façon de diagnostiquer et de prendre en charge les infections respiratoires. Il est temps de les utiliser.
Ces recommandations ne sont pas seulement de nature technique, elles sont transformatrices. Elles offrent un plan directeur pour des soins plus réactifs, efficaces et centrés sur le patient dans l’ensemble du système de santé espagnol.
« Nous avons surmonté les retards de diagnostic. L’ère de l’information rapide, précise et exploitable est arrivée. »
Le contenu présenté sur cette page est destiné à des fins informatives et éducatives. Bien qu’il soit disponible à l’échelle mondiale, il peut refléter des pratiques cliniques ou des enjeux en matière de système de santé propres à une région particulière.
Références :
1. Ortiz-de-Lejarazu R, Sagué M, Eiros JM, de la Flor J, Villar-Álvarez F, Fernández-Prada M, Jiménez-Jiménez AB, Sanz F, Gamazo JJ, Yáñez L, Gómez A, Rodríguez-Ledo P, Ortega J, Molero JM, Reina J, Solà-Morales O. Viral respiratory tract infections diagnosis: a Spanish survey and consensus approach. Diagn Microbiol Infect Dis. 2025 Sep;113(1):116831.
2. Vila J, Zboromyrska Y, Vergara A, Alejo I, Rubio E, Álvarez MJ, Puig J, Marcos MA. Métodos moleculares de diagnóstico de infecciones respiratorias. ¿Ha cambiado el esquema diagnóstico? Enferm Infecc Microbiol Clin. 2016;34(Supl 3):40–46. doi:10.1016/S0213-005X(16)30193-6
3. Stiver G. The treatment of influenza with antiviral drugs. CMAJ. 2003 Jan 7;168(1):49-56. PMID : 12515786; PMCID : PMC139319.
4. Vigilancia de Infección Respiratoria Aguda en Atención Primaria y Hospitales. Gripe, COVID-19 y VRS. Informe Anual Temporada 2023-2024. Centro Nacional de Epidemiología - Centro Nacional de Microbiología Instituto de Salud Carlos III. 2025 Feb. https://cne.isciii.es/documents/d/cne/informe_anual_sivira_2023-24_20250211
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