Candida auris : Menace croissante et implications futures

Candida auris en tant que menace mondiale

Les Centres américains pour le contrôle et la prévention des maladies (Centers for Disease Control and Prevention, CDC) ont qualifié Candida auris de « menace mondiale », jugeant le niveau de menace urgent.¹C. auris, agent pathogène fongique, est devenu un grave problème de santé en raison de son potentiel à provoquer des infections invasives et à augmenter la résistance aux médicaments antifongiques. D’abord découvert en 2009 au Japon,² C. auris a rapidement attiré l’attention en tant que cause potentielle d’infections du sang graves et potentiellement mortelles et d’épidémies dans les établissements de santé tels que les hôpitaux et les maisons de retraite.³

Signification clinique de C. auris

C. auris colonise la peau et le nez de certains patients hospitalisés sans provoquer de maladie.⁴ La colonisation par C. auris peut se propager dans les établissements de santé lorsqu’elle est transférée sur des surfaces sur lesquelles elle peut persister pendant des jours ou des semaines.³ La colonisation d’un patient peut persister pendant des mois, voire indéfiniment,⁵ ce qui offre une grande opportunité de propagation.

C. auris est un champignon particulièrement dur et résiste aux agents de décolonisation et de désinfection connus pour être efficaces contre d’autres espèces de Candida.³ Cela rend la gestion de l’épidémie particulièrement difficile.

Des maladies invasives graves ont été observées chez 5 à 10 % des personnes colonisées.⁶  Ces infections ont des taux de mortalité élevés chez les patients fragiles en milieu hospitalier et en maison de retraite, allant de 30 % à 72 %.³

Augmentation des cas pendant la pandémie de COVID-19

C. auris a été identifié en Asie du Sud, en Asie de l’Est, en Afrique, en Amérique du Sud et en Iran. Elle s’est répandue sur tous les continents, à l’exception de l’Antarctique³ avec une augmentation des cas observés pendant la pandémie de COVID-19.⁷

C. auris a commencé à se propager aux États-Unis en 2015 et le nombre de cas signalés a augmenté de 318 % en 2018 par rapport à la moyenne rapportée de 2015-2017.¹Cela a fait que les agences de santé publique, les spécialistes de la prévention des infections, les chercheurs et les prestataires de diagnostic ont pris conscience.

L’un des aspects les plus préoccupants de C. auris est son haut niveau de résistance aux médicaments antifongiques. Des échecs de traitement ont été rapportés avec certains médicaments antifongiques et une résistance à plusieurs classes de médicaments a été observée.^{1, 3}

Dans son rapport de 2019 sur les menaces de résistance aux antibiotiques, le CDC a noté que ses experts fongiques n’avaient jamais reçu de rapport décrivant une infection à Candida résistante à tous les médicaments antifongiques, et encore moins à Candida qui se propage facilement entre les patients.¹

En réponse à cette menace mondiale, le CDC a sonné l’alarme aux États-Unis et a qualifié C. auris comme l’une des 5 menaces antimicrobiennes urgentes pour la société.¹

L’approbation de la rezafungine par la Food and Drug Administration américaine en 2023 constitue une nouvelle option thérapeutique prometteuse pour les infections à C. auris, ⁸mais une détection rapide et précise du champignon est essentielle pour gérer cette menace.

Détection et identification en laboratoire

Le dépistage de C. auris chez les patients est une mesure préventive essentielle contre les épidémies dans les établissements de santé. Cependant, la détection et l’identification précises de C. auris peuvent être difficiles.

Les systèmes d’identification phénotypiques peuvent être inexacts, ce qui entraîne une mauvaise identification de C. auris.⁹  La culture du champignon nécessite des conditions de biosécurité spécifiques et prend des jours.

Le CDC recommande la spectrométrie de masse et les méthodes moléculaires telles que le séquençage et la PCR pour détecter et identifier C. auris avec précision. Les isolats peuvent également être envoyés aux laboratoires de santé publique et de référence pour identification. Bien que ces mécanismes fournissent des résultats précis, les établissements peuvent ne pas avoir accès à des technologies telles que la spectrométrie de masse et le séquençage. Le délai d’envoi des échantillons à analyser peut également entraîner des retards pendant la fenêtre critique pour détecter la colonisation et empêcher la propagation.

L’impact du dépistage par PCR en interne

La mise en œuvre de tests PCR internes pour dépister C. auris a donné des résultats positifs. Il permet une identification plus précoce des patients colonisés et des économies potentielles liées à l’isolement et aux tests.¹¹ Cette approche peut être plus efficace que l’envoi d’échantillons pour les tests tout en fournissant des résultats fiables.

La route devant nous

Tandis que les cas de C. auris continuent d’augmenter et que la résistance aux antimicrobiens devient plus prévalente, des solutions de tests plus rapides et plus précis seront des outils essentiels pour détecter les cas de manière précoce et aider à prévenir les épidémies.

Certains tests PCR commerciaux qui détectent C. auris existent.⁹ Cependant, les tests actuels sont conçus pour être réalisés par des professionnels formés dans des environnements de laboratoire.

Ces tests peuvent ne pas être facilement accessibles dans des établissements tels que les maisons de retraite, où résident certains des patients les plus sensibles aux infections graves à C. auris.

Un prototype de test de surveillance rapide et à la demande pour C. auris a été conçu pour fournir des résultats précis en moins d’une heure dans des environnements proches du patient.¹⁰

Le test prototype est conçu pour être réalisé sur le système GeneXpert® de Cepheid, qui permet de réaliser des tests en laboratoire et en biologie délocalisée. Un tel test pourrait conduire à une détection et une intervention précoces dans les établissements de santé, ce qui pourrait améliorer les résultats cliniques, financiers et opérationnels.

C. auris représente un défi important pour les systèmes de santé du monde entier en raison de son potentiel à provoquer des infections invasives, des taux de mortalité élevés et une résistance aux médicaments antifongiques. La vigilance, la formation du personnel, l’évolution des directives, le développement continu de médicaments et de méthodes de désinfection, ainsi que des solutions de tests innovantes, sont essentiels pour faire face à cette menace émergente.