Transformer le diagnostic des infections respiratoires

Temps de lecture : 5 min

17 février 2026

SANTÉ RESPIRATOIRE

Article

Transformer le diagnostic des infections respiratoires : adopter l’innovation moléculaire dans la pratique clinique

Par le Dr Raúl Ortiz de Lejarazu, Ph.D. Médecine, microbiologie médicale et bactériologie ; Directeur émérite du Centre national de lutte contre la grippe à Valladolid et Conseiller scientifique pour Cepheid en Espagne.

Un tournant dans le diagnostic respiratoire

Les infections respiratoires restent l’une des causes les plus fréquentes de consultations en Espagne. Pourtant, pendant trop longtemps, les cliniciens ont été contraints de prendre des décisions sans bénéficier de diagnostics rapides et précis. Ce paysage évolue grâce à l’innovation moléculaire.

« En médecine clinique et en microbiologie, nous travaillons souvent dans l’obscurité. Maintenant que nous pouvons avoir de la lumière, nous devons en profiter. »

En mai 2025, un consensus Delphi multidisciplinaire, approuvé par neuf spécialistes espagnols de premier plan issus de différentes sociétés médicales, a été publié dans le Journal of Diagnostic Microbiology & Infectious Disease1. J’ai eu l’honneur de coordonner ce groupe. Ensemble, nous avons fourni des recommandations nationales actualisées qui reconnaissent le rôle central des diagnostics moléculaires rapides dans la prise en charge des infections respiratoires aiguës (IRA).

Des cultures lentes aux résultats moléculaires rapides

Il y a seulement deux décennies, la culture cellulaire et les tests antigéniques pouvaient prendre jusqu’à 48 heures,2 ce qui était bien trop lent pour influencer le traitement de manière significative. Les diagnostics moléculaires ont tout changé.

Aujourd’hui, les tests PCR rapides permettent d’identifier des agents pathogènes tels que la grippe, le VRS et SARS-CoV-2. Pour la grippe, elle permet un traitement dans les 12 premières heures suivant l’apparition des symptômes, atténuant la maladie, accélérant le retour aux activités normales et évitant l’utilisation inutile d’antibiotiques3.

« Ce qui prenait autrefois des jours prend maintenant quelques minutes. Il ne s’agit pas seulement d’une avancée scientifique, mais également d’un impératif clinique. »

Recommandations clés du consensus Delphi1

Notre consensus souligne l’importance des tests PCR rapides pour :

  • Tous les patients hospitalisés atteints d’IRA symptomatiques
  • Les populations à haut risque : personnes âgées, immunodéprimées et patients présentant des comorbidités
  • Les patients pédiatriques nécessitant des soins spécialisés

 

 

Les diagnostics rapides contribuent également aux points suivants :

  • Bon usage des antimicrobiens en réduisant l’utilisation inutile d’antibiotiques 
  • Amélioration du flux de patients et réduction de la transmission nosocomiale dans les hôpitaux et les centres de soins de longue durée
  • Amélioration de la rentabilité dans les hôpitaux (par rapport aux tests antigéniques)
Soins primaires : la prochaine frontière

L’un des principaux défis reste : l’extension des tests moléculaires aux soins primaires et aux services d’urgence, là où la plupart des cas respiratoires commencent4. Cela nécessite des investissements et des preuves, non seulement en termes de rentabilité, mais également d’impact social et organisationnel.

« Notre prochaine étape consiste à éclairer les premiers points de contact avec les patients avec la même clarté que celle que nous avons apportée aux hôpitaux. »

Le groupe de travail appelle à une mise en œuvre plus large des tests de biologie moléculaire délocalisée et à d’autres études pour valider leur impact dans les environnements communautaires.

Un appel à l’action

Les outils existent maintenant pour transformer la façon dont nous diagnostiquons et prenons en charge les infections respiratoires. Il est temps de les utiliser.

Ces recommandations ne sont pas seulement techniques, elles sont porteuses de transformation. Elles offrent un plan pour des soins plus réactifs, efficaces et centrés sur le patient dans l’ensemble du système de santé espagnol.

« Nous avons surmonté les retards de diagnostic. L’ère des informations rapides, précises et exploitables est arrivée. »

Dr Raúl Ortiz de Lejarazu

Le contenu présenté sur cette page est destiné à des fins informatives et éducatives. Bien qu’elle soit disponible à l’échelle mondiale, elle peut refléter les pratiques cliniques ou les considérations du système de santé spécifiques à une région particulière.

Références :

1. Ortiz-de-Lejarazu R, Sagué M, Eiros JM, de la Flor J, Villar-Álvarez F, Fernández-Prada M, Jiménez-Jiménez AB, Sanz F, Gamazo JJ, Yáñez L, Gómez A, Rodríguez-Ledo P, Ortega J, Molero JM, Reina J, Solà-Morales O. Viral respiratory tract infections diagnosis: a Spanish survey and consensus approach. Diagn Microbiol Infect Dis. 2025 Sep;113(1):116831.

2. Vila J, Zboromyrska Y, Vergara A, Alejo I, Rubio E, Álvarez MJ, Puig J, Marcos MA. Métodos moleculares de diagnóstico de infecciones respiratorias. ¿Ha cambiado el esquema diagnóstico? Enferm Infecc Microbiol Clin. 2016;34(Supl 3):40–46. doi:10.1016/S0213-005X(16)30193-6

3. Stiver G. The treatment of influenza with antiviral drugs. CMAJ. 2003 Jan 7;168(1):49-56. PMID: 12515786; PMCID: PMC139319. 

4. Vigilancia de Infección Respiratoria Aguda en Atención Primaria y Hospitales. Gripe, COVID-19 y VRS. Informe Anual Temporada 2023-2024. Centro Nacional de Epidemiología - Centro Nacional de Microbiología Instituto de Salud Carlos III. 2025 février https://cne.isciii.es/documents/d/cne/informe_anual_sivira_2023-24_20250211

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